取卵的过程是病人仰卧在手术床上，呈截石位，医生消毒，铺无菌洞巾，把带有穿刺针的经阴道超声探头放入女方生殖道内，超声检查确定两侧卵巢卵泡，在超声引导下经阴道的穹窿出穿刺入腹腔，先进行一侧卵巢的卵泡抽吸，一侧抽吸完再进行另一侧卵巢的抽吸。分别抽取两侧卵泡液，退出穿刺针，取出超声探头，稍躺一会，离开诊床，回休息室休息观察。

取卵时可以麻醉下取卵，，也可以不用麻醉药而采用镇痛药，如果是静脉麻醉下进行取卵手术，整个过程女性不会感受到疼痛。取卵过程大概持续10到15分钟，取卵完毕，实验室人员需要在卵泡液中查找卵子，与优化处理后的精子按一定比例混合或采用单精注射方式使之受精形成胚胎。

取卵之后，建议休息3个月再考虑下周期的取卵。休息三个月的主要原因是为了让卵巢得到一个良好的恢复。卵子长在卵泡液里，取卵时，只是将卵子和卵泡液一同吸出，但包着卵泡液的荚膜是取不走的，它会留在卵巢里、只有等它逐渐被身体吸收后才可长出新的卵子。而当取出多个卵子时，荚膜数量就会比较多，完全吸收时间就会较长。还有卵泡内的液体虽然随着卵子被吸走、但它立刻就又会生成。所以取了大量卵子的人、卵巢内残留组织马上会又储留很多卵泡液、如果过多了就会引起腹水。所以建议取卵后休息2-3个月，不应连续取卵。